اینتگراز ۱

۹۴ (۶/۶۷%)

۴۵ (۴/۳۲%)

۱۳۹ (۱۰۰%)

اینتگراز ۲

۲۹ (۹/۲۰%)

۱۱۰ (۱/۷۹%)

۱۳۹ (۱۰۰%)

هر دو اینتگراز

۱۲ (۶/۸%)

۱۲۷ (۴/۹۱%)

۱۳۹ (۱۰۰%)

نمودار ۵-۴: نمودار درصد موارد مثبت و منفی ژن اینتگراز۱ و ژن اینتگراز۲ و حضور همزمان هر دو ژن اینتگراز در تمام جدایه های E. coli مورد بررسی در این مطالعه
تصویر۱-۴: تصویر ژل الکتروفورز، چاهک ۱ مارکر ۱۰۰ جفت بازی است. چاهک ۲ نمونه کنترل منفی، چاهک ۳ کنترل مثبت ژن اینتگراز ۲ با طول۴۰۳ bp، چاهک ۴ نمونه کنترل مثبت ژن اینتگراز ۱ با طول ۵۶۴ bp، چاهک‌های ۵و۶ نمونه‌های فاقد اینتگراز ۱ یا ۲، چاهک‌های ۷و۸و۹و۱۲ نمونه‌های دارای ژن اینتگراز ۱، چاهک‌های ۱۰و۱۱ نمونه‌های دارای هر دو ژن اینتگراز، و چاهک ۱۳ نمونه‌ی دارای ژن اینتگراز ۲ می‌باشند
۲-۴ نتایج بررسی کاست ژنی کلاس ۱ اینتگرون‌ها
پس از انجام PCR با پرایمرهای مخصوص کاست کلاس۱ بر روی نمونه‌هایی که دارای ژن اینتگراز ۱ بودند. الگوهای متفاوت باندهای محصولات PCR با الکتروفورز روی ژل آگارز معلوم شد (تصویر۲-۴ و تصویر ۳-۴).
تصویر ۲-۴: الگوی باند‌های محصولات PCR کاست ژنی کلاس ۱ اینتگرون‌ها با طول متفاوت پس از الکتروفورز روی ژل آگارز
کاست‌های ژنی کلاس ۱ اینتگرون‌ها طول‌های متفاوتی داشتند که از حدود ۱۵۰۰ جفت باز تا بالاتر از ۳۰۰۰ جفت باز متغیر بود. به علت عدم درجه بندی مارکر bp100در فاصله ۱۵۰۰ تا ۳۰۰۰ جفت باز و همچنین عدم توانایی این مارکر در تعیین طول مقادیر بالاتر از ۳۰۰۰ جفت باز، تعیین طول دقیق باند‌های حاصل از کاست ژنی اینتگرون کلاس۱ امکان‌پذیر نبود و تنها اندازه تقریبی آنها تخمین زده شد. با این وجود، اختلاف طول آنها کاملا واضح بود .
تصویر ۳-۴: الگوی باند‌های محصولات PCR کاست ژنی کلاس ۱ اینتگرون‌ها با طول متفاوت پس از الکتروفورز روی ژل آگارز
۳-۴ نتایج تعیین توالی کاست‌ ژنی کلاس ۱ اینتگرون‌ها
از محصولات PCR کاست ژنی کلاس ۱ اینتگرون‌ها که طول متفاوت داشتند نمونه‌هایی برای توالی یابی و تعیین محتوای ژنتیکی به شهر سئول در کره‌ی جنوبی، ارسال گشت. اطلاعات محصولات کاست ژنی کلاس ۱ اینتگرون‌ها که برای تعیین توالی انتخاب و ارسال شدند درجدول۶-۴ آمده است.

جدول ۶-۴: کد نمونه، طول کاست ژنی و ژنهای موجود در کاست ژنی کلاس ۱ اینتگرون‌ها در محصولات PCR تعیین ترادف شده

ژن‌های موجود در کاست

طول کاست ژنی (جفت باز)

کد نمونه

(aadA1) & (dfrA1)

۱۵۸۶

C117

(dfrA1) & (aadA1)

۱۵۸۶

C137

(aadA5) & (dfrA17)

۱۶۶۴